- Europos socialinio fondo agentūra
- Kvalifikacijų ir profesinio mokymo plėtros centras
- Lietuvos mokinių neformaliojo švietimo centras
- Lietuvos vaikų ir jaunimo centras
- Mokslo ir enciklopedijų leidybos centras
- Mokslo, inovacijų ir technologijų agentūra
- Nacionalinė švietimo agentūra
- Nacionalinis vėžio institutas
- Studijų kokybės vertinimo centras
- Švietimo mainų paramos fondas
- Valstybinis studijų fondas
- Vilniaus lietuvių namai